El análisis metagenómico revela alteraciones de la microbiota orofaríngea en pacientes con COVID-19

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Comentarios: Dr. Francisco Mera Cordero. Investigador estudio E-Speranza covid. Redactor de ElTelemedicina.com

Este estudio, https://www.nature.com/articles/s41392-021-00614-3, se encuentra entre los estudios pioneros para explorar las características metagenómicas del microbioma orofaríngeo en pacientes con COVID-19 con diversa gravedad (leve, moderada, grave o crítica) en comparación con pacientes con gripe y controles sanos .Un análisis bioinformático de los datos de secuenciación metagenómica obtenidos en el estudio mostró que la infección por SARS-CoV-2 altera la composición de la microbiota orofaríngea y causa disbiosis del microbioma local, que puede inducir la translocación de patógenos orales en el pulmones para causar coinfecciones pulmonares.

Existe una disminución en la diversidad del microbioma oral en la infección grave por SARS- CoV2, induciendo la presencia de disbiosis en la microbiota orofaríngea. Se planteo la hipótesis de que los géneros de bacterias orales que aumentan en COVID-19 como Veillonella y Megasphaera pueden ser patógenos cuando se transfieren a otros órganos del cuerpo. Datos convincentes indicaron que los niveles de ocho de cada diez especies estaban sobrerrepresentados en el BALF de los pacientes con COVID-19, lo que confirma que la cavidad oral puede ser una fuente de patógenos que infectan el pulmón. Varios estudios han demostrado un vínculo entre un buen cuidado bucal y un riesgo reducido de infección del tracto respiratorio y la mortalidad relacionada con la neumonía en las personas mayores. Por lo tanto, los resultados del presente estudio son clínicamente significativos porque las variaciones en el microbioma orofaríngea de COVID-19 pacientes se pueden utilizar como biomarcadores no invasivos de disbiosis del microbioma pulmonar o de la invasión de patógenos potenciales en el pulmón.

Se ha demostrado que el género Veillonella es un indicador compartido de COVID-19 en múltiples estudios,  una causa de neumonitis anaeróbica crónica,  y está presente en una gran abundancia en la cavidad oral de individuos con artritis reumatoide.  Varios miembros del género Veillonella son patógenos periodontales y están sobrerrepresentados en el BALF de los pacientes con COVID-19. Además, generamos un clasificador microbiano para distinguir a los pacientes con COVID-19 de los pacientes con gripe y los controles sanos con un AUC de 0,889, y el clasificador identificó a Veillonella como el principal predictor. Así, Veillonellapuede contribuir a la gravedad de COVID-19, aunque el mecanismo exacto del efecto requiere una mayor exploración.

Varias especies se correlacionaron con la gravedad de COVID-19 e, como Klebsiella sp ., Acinetobacter sp ., Serratia sp . Y Veillonella tobetsuensis , fueron identificadas como indicadores de gravedad de VAP 26 o COVID-19.9 en otros estudios, lo que respalda aún más los hallazgos. Debido a la contribución de las coinfecciones bacterianas a la mortalidad y al aumento de la gravedad de la enfermedad en las infecciones por COVID-19, se espera que las bacterias orofaríngeas se utilicen como predictores sólidos de la gravedad de COVID-19 y como objetivos de intervención.

Se ha informado que muchos factores de riesgo influyen en la gravedad de COVID-19,  incluidos el sexo, la edad y las comorbilidades. Sin embargo, una proporción sustancial de pacientes infectados aparentemente sanos sin factores de riesgo identificados también sufren complicaciones graves, lo que sugiere que se deben considerar otros factores de riesgo, como la higiene bucal o la disbiosis del microbioma.

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